Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALX3O95076 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALX3O95076 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALX3O95076 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALX3O95076 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALX3O95076 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALX3O95076 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALX3O95076 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALX3O95076 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALX3O95076 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALX3O95076 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALX3O95076 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALX3O95076 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALX3O95076 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALX3O95076 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms