Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNSO60931 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms