Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms