Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18L2Q9UHA2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms