Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms