Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl11aQ9QYE3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl11aQ9QYE3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms