Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms