Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms