Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms