Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms