Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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