Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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KCNC3Q14003 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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KCNC3Q14003 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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KCNC3Q14003 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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KCNC3Q14003 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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KCNC3Q14003 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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KCNC3Q14003 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNC3Q14003 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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