Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms