Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms