Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms