Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms