Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms