Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LTBRP36941 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LTBRP36941 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LTBRP36941 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LTBRP36941 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms