Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms