Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC103876.1-203ENST00000565495 290 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 WFDC5-201ENST00000307971 1034 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 C10orf82-201ENST00000369210 994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LDHAP7-201ENST00000398295 965 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ENY2-208ENST00000520147 857 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AL031587.3-201ENST00000609976 814 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.206-201ENST00000612004 332 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC011525.2-202ENST00000590611 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LINC01823-203ENST00000435895 766 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 THAP6-211ENST00000507885 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC010976.1-205ENST00000596439 1007 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ACTG1P22-202ENST00000605503 859 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms