Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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