Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms