Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms