Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms