Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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