Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM4Q9C037 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms