Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOL4Q9BPW4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms