Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4DQ92854 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4DQ92854 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4DQ92854 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4DQ92854 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4DQ92854 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4DQ92854 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4DQ92854 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4DQ92854 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4DQ92854 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4DQ92854 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4DQ92854 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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