Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC12Q8WUD4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms