Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms