Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms