Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms