Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms