Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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RTN1Q16799 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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RTN1Q16799 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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