Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PDK4Q16654 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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