Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF239Q16600 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF239Q16600 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF239Q16600 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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