Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms