Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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