Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms