Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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