Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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