Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms