Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms