Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms