Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX6P78412 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX6P78412 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX6P78412 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX6P78412 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX6P78412 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX6P78412 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX6P78412 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX6P78412 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX6P78412 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms