Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPIAP49247 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPIAP49247 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms