Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NSG1P42857 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NSG1P42857 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSG1P42857 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSG1P42857 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSG1P42857 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSG1P42857 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSG1P42857 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSG1P42857 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms