Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPARGP37231 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms