Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms