Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms